定量蛋白質(zhì)組學(xué)方法也可以用label-free的方法,即非標記法。非標記蛋白質(zhì)組定量質(zhì)譜檢測的優(yōu)點(diǎn)就是樣品上機前,不需要特殊標記操作,操作非常方便,也節省了標記試劑的費用。結合使用Maxquant軟件進(jìn)行分析,可以做到定量檢測。Maxquant軟件非標記定量分析是以MS1為基礎,實(shí)驗證明結合Maxquant軟件分析的非標記技術(shù)具有較好的定量準確性和可靠性。最新一代Orbitrap Exploris 480高性能質(zhì)譜儀能極大的提高蛋白質(zhì)組檢測的深度或覆蓋度,檢測結果具有更高的重復性,能檢測蛋白質(zhì)組微量蛋白的變化。
◆ 蛋白質(zhì)組學(xué)非標記定量分析的特點(diǎn)
1. 對液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜的穩定性和重復性要求較高
2. 無(wú)需昂貴的標記試劑
3. 對樣本的數量無(wú)限制,克服了標記定量技術(shù)在對多個(gè)樣本進(jìn)行定量方面的缺陷
檢測流程:
使用儀器:
Thermo Scientific Exactive HF,HFX, Orbitrap Exploris 480 質(zhì)譜儀
技術(shù)優(yōu)勢:
采用新一代高分辨率質(zhì)譜儀,檢測更靈敏 ,覆蓋度更高
豐富的質(zhì)譜檢測與數據分析經(jīng)驗
樣品要求:
實(shí)驗樣本預處理及運輸注意事項:
檢測樣品 | 樣品 要求 |
細胞樣品 | 細胞數量 >5×106 |
組織樣品 | 動(dòng)物植物組織 >10mg |
蛋白質(zhì)溶液 | 蛋白質(zhì)總量>200μg,濃度>1μg/μl;說(shuō)明裂解液成分,濃度信息等 |
⊙蛋白質(zhì)溶液:定量并計算總蛋白量,密封好管口,干冰包裝寄送。
特別提醒:快遞寄送樣本運輸過(guò)程中,可能晃動(dòng)幅度會(huì )比較大,請做好基本運輸防護措施。
注:在寄送樣本時(shí),請填寫(xiě)好樣本登記表,隨樣本一同寄往本公司。
實(shí)驗周期:
樣品數目 | 2-6個(gè) | 7-10個(gè) | 10個(gè)以上 |
實(shí)驗周期 | 3 weeks | 4 weeks | 5 weeks |
參考文獻:
Bekker-Jensen et al., A Compact Quadrupole-Orbitrap Mass Spectrometer with FAIMS Interface Improves Proteome Coverage in Short LC Gradients, Molecular & Cellular Proteomics, 2020 19, 716 –729
Piero Giansanti, et al., Mass spectrometry-based draft of the mouse proteome, Nature Methods volume 19, pages803–811 (2022)