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群落多樣性組成譜測序以細菌 / 古菌 16S rRNA 基因可變區、真菌 18S r RNA 基因可變區或真菌 ITS（Internal transcribed spacer）內轉錄間隔區等微生物特征序列（Signature sequence）為靶點(diǎn)，通過(guò)檢測序列的變異和數量，反映群落 中各類(lèi)微生物物種的身份和豐度，從而快速解析群落物種分布特征，闡明樣本間多樣性和組成差異，進(jìn)而發(fā)現差異相 關(guān)物種。
技術(shù)特點(diǎn)
1. 直接對群落樣本中的微生物特征序列進(jìn)行擴增檢測，簡(jiǎn)單快速，并克服了大部分微生物無(wú)法純培養的難題；
2. 自動(dòng)化、專(zhuān)業(yè)的 DNA 提取流程，配合高保真 DNA 聚合酶進(jìn)行 PCR 擴增，并嚴格把控擴增循環(huán)數，確保群落組成客觀(guān)真實(shí)；
3. 使用 Illumina NovaSeq/MiSeq 和 PacBio Sequel II 進(jìn)行測序， 2×250 bp、2×300 bp、>1 kb 的多種長(cháng)度均可適配，每個(gè)樣本都能一次性獲得數萬(wàn)條序列，即使低豐度物種也能定量；
4. 采用 QIIME 2 分析流程， DADA2、物種注釋、PICRUSt2 功能潛能預測等方法覆蓋；
5. 提供分析結果，和發(fā)表等級的動(dòng)態(tài)交互可視化效果。
項目流程
微生物組總DNA提取→目標片段PCR擴增→擴增產(chǎn)物檢測定量→測序文庫制備→上機進(jìn)行高通量測序→生信分析
分析內容
典型分析結果展示
Beta 多樣性PCoA分析
關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò )的模塊化分析
PICRUSt2 功能潛能預測物種組成分層分析
